《百妖谱 第二季》是部反映多主题的动画片，观众可从中观察到弱肉强食的社会也可看到独立成长的重要性。《百妖谱 第二季》完美的诠释了一个心灵的成长史，营造的光影之梦是如此的卓尔不凡，这部动画是导演最出色的佳作。故事简单而抽象，传递着最为真挚的情感，《百妖谱 第二季》有着对爱的探讨，爱作为一种情感，本身很难有一个精确的定义，主角从一开始的冷漠、自私、怯懦，逐渐变成了一个懂爱的女孩，她忍耐、恩慈、包容，这些都是爱所包含的元素。侧面反映出了善良总是能压倒一切，只要付出，善良的人总会获得回报。
桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。
